邓白氏编码

来源:互联网转载和整理 2023-08-27 09:31:50

邓白氏编码是一种在分子生物学领域,用于标识不同菌株的一种编码方法。它通过缩写从简单的标识符中提取出一个包含隐含信息的缩写,从而使不同菌株可以对应特定的信息,从而帮助辨认和研究该菌株的定位及属。邓白氏编码包括两个部分,一部分是统一的菌株属名(大写字母),另外的是缩写的核心信息(小写字母,数字和点)。

使用邓白氏编码来标识一个物种的菌株,首先要求其在该种特定的菌株中有特定的属名或学名,其次,进一步的编码过程包括收集特定菌株的一些基本信息,如供体、孢芽形态、酸度等,将所收集的这些信息缩写至邓白氏编码样式,如“L.sp ABC-1-2-3”,然后即可获得最终的邓白氏编码。其中,“L.sp”表示特定的菌株属名,“ABC”则是有特定的隐私含义的三位缩写码,“1-2-3”则是该菌株所具有的特征属性,后缀数字如“2-3-4”也是可加以变化的,表示菌株在某一特定特征下独特的状况。 在实际操作中,菌株属名应为统一的国际菌种拉丁名法或英文学术命名,缩写码ABC则是用于代表菌株特异性的任意字母组合,具体组合方式依据研究者原则进行,该字母组合中的每个字母代表不同的特征,而后缀表示具体的状况,给出在特定方面上的细微差别。例如,Species nomenclature可缩写为Sp.,而菌株的密度则可用Dm表示,培养基的缩写则可用S表示,例如“L.sp DmS-4”表示具有特殊密度(Dm)和特定培养基(S)的特定状态(4)的菌株。

邓白氏编码有利于节省学术报道中用来描述菌株基本信息的空间,使得介绍不同物种不同菌株及其属性更加简便,并且能快速辨识复制菌株和遗传改造。邓白氏编码也可以作为数据库等信息系统的格式,作为介绍和比较菌株等信息的准确索引。